Mucho ha cambiado el Mar menor en los últimos 15 años. Diversas razones que nadie sabe en que proporciones hayan podido influir, pero que es obvio que entre todas ellas se hallan las causas, han hecho que su equilibrio haya dado un vuelco ecológico espectacular de incalculables resultados.
A saber: gran incremento de los intercambios de agua, especies animales y vegetales, como consecuencia del dragado del canal del Estacio para el paso de barcos recreativos; bajada de la temperatura media del agua; bajada de la salinidad del agua; colonización por nuevas especies vegetales y animales (como ejemplo vegetal podemos citar el alga Caulerpa Prolifera, que se ha extendido en grandes superficies, desplazando a la Acetabularia que era el principal alimento de las especies que poblaban la laguna; como ejemplo animal el molusco gasterópodo Murex Trunculus que se ha reproducido a gran velocidad, esta especie depredadora del berberecho ha hecho disminuir enormemente la población de este, por no citar la epidemia de medusas que desde hace años padece); crecimiento exponencial de barcos a motor surcando sus aguas y proliferación de puertos deportivos; presión humana insoportable para la laguna en los meses veraniegos; aumento de nutrientes como consecuencia de los arrastres y filtraciones, de aguas con fuerte contenido en abonos de las grandes superficies de cultivo agrícola del campo de Cartagena; aumento de los fangos y colmatación de de los fondos como consecuencia de los arrastres de las lluvias torrenciales; la regenaración y creación de playas artificiales que ha removido y trasladado cientos de miles de toneladas de arena, arrasando praderas vegetales e impidiendo la puesta de huevos y desarrollo de especies animales, es evidente que esta acción ha sido motivada exclusivamente por criterios de rentabilidad política.
Este tremendo combinado de factores ha dado el resultado que a lo largo de esta sección trataremos de definir.